不管是什么食品，轉(zhuǎn)基因的都是對人體的有害的。所以在食物方面，選擇有機、非轉(zhuǎn)基因的食品是非常好的。
改變環(huán)境
轉(zhuǎn)基因食品在種植、生長過程中，與非轉(zhuǎn)基因作物還是有很多區(qū)別的，對土壤和周邊的生態(tài)環(huán)境會造成一定的影響，且這種影響也不一定是正面的。
害蟲升級
轉(zhuǎn)基因食品本身就還有滅殺害蟲的基因，但是害蟲可以依靠淘汰、進化，對這種特征產(chǎn)生更高的抵御性，造成農(nóng)藥也無法滅殺的可能。
減少非轉(zhuǎn)基因作物
轉(zhuǎn)基因作物便宜、好種、產(chǎn)量大，因此，許多農(nóng)戶都樂于種植換基因作物，像傳統(tǒng)的非轉(zhuǎn)基因大豆產(chǎn)地東北，本地大豆逐年減少種植，取而代之的是轉(zhuǎn)基因大豆，這種情況很有可能造成非轉(zhuǎn)基因作物種子的停產(chǎn)和滅絕。
影響生育
對小白鼠做過的關(guān)于轉(zhuǎn)基因食品喂食的實驗表明，轉(zhuǎn)基因食品會對小白鼠的繁殖和生育能力產(chǎn)生嚴重的影響，一般3-4代以后，將出現(xiàn)繁育困難的可能。因此，對人類而言，轉(zhuǎn)基因食品也可能存在同一問題。
心理恐慌
即使轉(zhuǎn)基因食品不存在任何生理性的危害，但是正常人在選擇食品時，任然傾向于選擇非轉(zhuǎn)基因的，所以，長期食用轉(zhuǎn)基因食品，并且自己也知情的話，會造成一定的心理負擔，產(chǎn)生心理性疾病。